François Habert fit tout d’abord des études à Paris où il marqua un goût prononcé pour les lettres. Son père l’envoya ensuite à Toulouse pour étudier la jurisprudence. Il dut interrompre cette voie à la mort de son père,  qui sans fortune le laissa donc sans le sous. De retour à Issoudun, sa ville natale, presque sans ressources, ayant quatre sœurs à soutenir, il prit l'emploi de secrétaire auprès de plusieurs prélats puis du duc de Nevers qui le produisit à la Cour. Il y fut favorablement accueilli de François Ier et plus tard par Henri II qui l'honora du titre de son poète. Il y fréquenta semble-t-il Mellin De Saint-Gelais.

C’est en 1541 que François Habert publia ses premières pièces poétiques sous le titre du Banni de lyesse en référence à sa pauvreté. Ce recueil se compose de plusieurs épîtres, rondeaux, ballades, épitaphes… ainsi que du Livre des Visions fantastiques, imitation du sixième chant de l'Enéide de Virgile, et de diverses traductions. Ses autres productions sont très nombreuses, on peut citer : Le Songe de Pantagruel (1542), La Nouvelle Vénus, Le Temple de la Chasteté (1549), où il s’emploi notamment à des imitations de Martial,  Misère de l'homme naissant en ce monde (1551), une traduction des Métamorphoses et des Élegies amoureuses d’Ovide.

A noter qu’il a également écrit un recueil de fables, dont quelques-unes ont été reprises par La Fontaine, et que le poète Isaac Habert est son neveu.